Puedes subir tus productos a Shop desde el apartado Catálogo > Productos, seleccionas todos los productos o solo aquellos que necesites, pulsar en Más > Publicar en Shop.

Otra opción es acceder a la ficha del producto > pestaña Shop, pulsar en Editar dentro de la pestaña y marcar la casilla Mostrar en Shop.

También puedes hacerlo masivamente por medio de una actualización desde Configuración > Importar/Exportar > Actualizar desde fichero, indicando en tipo de información "Productos Shop" y en el campo "Mostrar Shop" indicar Si.