Para llevar la trazabilidad de una factura de abono hay que generarla desde la factura ordinaria. Pulsa Más > Generar > Factura de abono.
Si quieres compensar esas facturas, debes marcar la factura ordinaria como cobrada y la factura de abono como pagada.
De esta forma, ambas facturas estarán compensadas.
Puedes indicar en el campo Título de la factura de abono, “Abonada”, para que conste esa información. También puedes indicarla en el recibo de la factura de abono, en el campo Concepto.