Ese mensaje se muestra debido a que tienes que registrar el dispositivo desde el que emites las facturas, en Hacienda.

Desde este enlace podrás acceder y seguir los pasos para que tu dispositivo quede perfectamente registrado y puedas emitir tus facturas sin problemas

En la web de Hacienda debes de hacer click en el Tick Verde que les muestra, ya que para que se quede guardada la configuración del registro.