Para cambiar el color de un estado personalizado debes de seguir los siguientes pasos; Primero acceder a Configuración > Configuración avanzada > Estados personalizados y pulsar sobre el tipo de documento en el que hayas guardado dicho estado, al que quieres modificar el color asociado.

Una vez accedes a los estados asociados a dicho documento sólo tienes que pulsar editar y pulsar sobre el color a modificar, a continuación podemos elegir diferentes colores o incluso añadir el código hexadecimal, una vez tenemos el color elegido pulsar en guardar.