Si, pero debes de tener en cuenta que el único documento que permite escoger diferentes documentos y crear una factura es el albarán / nota de entrega , por tanto el proceso sería el siguiente; 

Ir a Compras > Pedidos de proveedor > Selecciona los pedidos y pulsa en Más > Generar Albarán de proveedor.

Una vez realizado este proceso accedemos a Compras > Albaranes de proveedor > seleccionamos los albaranes > pulsar en Más > Generar > Factura de proveedor.