En STEL Order dispones de la opción "Facturar a", con la cual podrás asignar un cliente distinto del que indicaste en el documento. 

De esa forma al generar la factura, mostrará el nombre del cliente que indicaste en ese campo.

Recuerda la opción "Facturar a", solamente está disponible en el módulo de SAT, por lo tanto tendrás que indicarlo en un presupuesto, pedido o albarán para que al generar la factura se aplique el cambio.